Datos de sensores ambientales

Sensor.Community es una red global de sensores impulsada por la comunidad que crea Open Environmental Data. Los datos se recopilan a partir de sensores de todo el mundo. Cualquiera puede comprar un sensor y colocarlo donde quiera. Las API para descargar los datos están en GitHub y los datos están disponibles libremente bajo la Database Contents License (DbCL).

El conjunto de datos tiene más de 20 mil millones de registros, así que tenga cuidado al copiar y pegar los comandos a continuación, a menos que sus recursos puedan manejar ese volumen. Estos comandos se ejecutaron en un servicio de ClickHouse Cloud con capacidad suficiente.

Para probar estos comandos, puede registrarse para obtener una prueba gratuita de ClickHouse Cloud o configurar una instancia autogestionada de ClickHouse.

Los datos están en S3, así que podemos usar la función de tabla s3 para crear una tabla a partir de los archivos. También podemos consultar los datos directamente. Veamos algunas filas antes de intentar insertarlos en ClickHouse:

SELECT *
FROM s3(
    'https://clickhouse-public-datasets.s3.eu-central-1.amazonaws.com/sensors/monthly/2019-06_bmp180.csv.zst',
    'CSVWithNames'
   )
LIMIT 10
SETTINGS format_csv_delimiter = ';';

Los datos están en archivos CSV, pero usan punto y coma como delimitador. Las filas tienen este aspecto:

┌─sensor_id─┬─sensor_type─┬─location─┬────lat─┬────lon─┬─timestamp───────────┬──pressure─┬─altitude─┬─pressure_sealevel─┬─temperature─┐
│      9119 │ BMP180      │     4594 │ 50.994 │  7.126 │ 2019-06-01T00:00:00 │    101471 │ ᴺᵁᴸᴸ     │ ᴺᵁᴸᴸ              │        19.9 │
│     21210 │ BMP180      │    10762 │ 42.206 │ 25.326 │ 2019-06-01T00:00:00 │     99525 │ ᴺᵁᴸᴸ     │ ᴺᵁᴸᴸ              │        19.3 │
│     19660 │ BMP180      │     9978 │ 52.434 │ 17.056 │ 2019-06-01T00:00:04 │    101570 │ ᴺᵁᴸᴸ     │ ᴺᵁᴸᴸ              │        15.3 │
│     12126 │ BMP180      │     6126 │ 57.908 │  16.49 │ 2019-06-01T00:00:05 │ 101802.56 │ ᴺᵁᴸᴸ     │ ᴺᵁᴸᴸ              │        8.07 │
│     15845 │ BMP180      │     8022 │ 52.498 │ 13.466 │ 2019-06-01T00:00:05 │    101878 │ ᴺᵁᴸᴸ     │ ᴺᵁᴸᴸ              │          23 │
│     16415 │ BMP180      │     8316 │ 49.312 │  6.744 │ 2019-06-01T00:00:06 │    100176 │ ᴺᵁᴸᴸ     │ ᴺᵁᴸᴸ              │        14.7 │
│      7389 │ BMP180      │     3735 │ 50.136 │ 11.062 │ 2019-06-01T00:00:06 │     98905 │ ᴺᵁᴸᴸ     │ ᴺᵁᴸᴸ              │        12.1 │
│     13199 │ BMP180      │     6664 │ 52.514 │  13.44 │ 2019-06-01T00:00:07 │ 101855.54 │ ᴺᵁᴸᴸ     │ ᴺᵁᴸᴸ              │       19.74 │
│     12753 │ BMP180      │     6440 │ 44.616 │  2.032 │ 2019-06-01T00:00:07 │     99475 │ ᴺᵁᴸᴸ     │ ᴺᵁᴸᴸ              │          17 │
│     16956 │ BMP180      │     8594 │ 52.052 │  8.354 │ 2019-06-01T00:00:08 │    101322 │ ᴺᵁᴸᴸ     │ ᴺᵁᴸᴸ              │        17.2 │
└───────────┴─────────────┴──────────┴────────┴────────┴─────────────────────┴───────────┴──────────┴───────────────────┴─────────────┘

Usaremos la siguiente tabla MergeTree para almacenar los datos en ClickHouse:

CREATE TABLE sensors
(
    sensor_id UInt16,
    sensor_type Enum('BME280', 'BMP180', 'BMP280', 'DHT22', 'DS18B20', 'HPM', 'HTU21D', 'PMS1003', 'PMS3003', 'PMS5003', 'PMS6003', 'PMS7003', 'PPD42NS', 'SDS011'),
    location UInt32,
    lat Float32,
    lon Float32,
    timestamp DateTime,
    P1 Float32,
    P2 Float32,
    P0 Float32,
    durP1 Float32,
    ratioP1 Float32,
    durP2 Float32,
    ratioP2 Float32,
    pressure Float32,
    altitude Float32,
    pressure_sealevel Float32,
    temperature Float32,
    humidity Float32,
    date Date MATERIALIZED toDate(timestamp)
)
ENGINE = MergeTree
ORDER BY (timestamp, sensor_id);

Usaremos la función de tabla s3Cluster, que distribuye los archivos de S3 entre los nodos de tu clúster para que se lean en paralelo. En ClickHouse Cloud, tu clúster se llama default y puedes ejecutar la consulta como se muestra. En un servidor autogestionado, sustituye default por el nombre de tu clúster o, si usas un solo servidor, utiliza la función de tabla s3 y elimina el primer argumento para que la llamada comience con la URL.

Esta consulta tardará un poco: son aproximadamente 1,67 T de datos sin comprimir:

INSERT INTO sensors
    SELECT *
    FROM s3Cluster(
        'default',
        'https://clickhouse-public-datasets.s3.amazonaws.com/sensors/monthly/*.csv.zst',
        'CSVWithNames',
        $$ sensor_id UInt16,
        sensor_type String,
        location UInt32,
        lat Float32,
        lon Float32,
        timestamp DateTime,
        P1 Float32,
        P2 Float32,
        P0 Float32,
        durP1 Float32,
        ratioP1 Float32,
        durP2 Float32,
        ratioP2 Float32,
        pressure Float32,
        altitude Float32,
        pressure_sealevel Float32,
        temperature Float32,
        humidity Float32 $$
    )
SETTINGS
    format_csv_delimiter = ';',
    input_format_allow_errors_ratio = '0.5',
    input_format_allow_errors_num = 10000,
    input_format_parallel_parsing = 0,
    date_time_input_format = 'best_effort',
    max_insert_threads = 32,
    parallel_distributed_insert_select = 1;

Esta es la respuesta: muestra el número de filas y la velocidad de procesamiento. ¡Se insertan a una tasa de más de 6 millones de filas por segundo!

0 rows in set. Elapsed: 3419.330 sec. Processed 20.69 billion rows, 1.67 TB (6.05 million rows/s., 488.52 MB/s.)

Veamos cuánto espacio de almacenamiento en disco se necesita para la tabla sensors:

SELECT
    disk_name,
    formatReadableSize(sum(data_compressed_bytes) AS size) AS compressed,
    formatReadableSize(sum(data_uncompressed_bytes) AS usize) AS uncompressed,
    round(usize / size, 2) AS compr_rate,
    sum(rows) AS rows,
    count() AS part_count
FROM system.parts
WHERE (active = 1) AND (table = 'sensors')
GROUP BY
    disk_name
ORDER BY size DESC;

Los 1,67 T se comprimen hasta 310 GiB y hay 20 690 millones de filas:

┌─disk_name─┬─compressed─┬─uncompressed─┬─compr_rate─┬────────rows─┬─part_count─┐
│ s3disk    │ 310.21 GiB │ 1.30 TiB     │       4.29 │ 20693971809 │        472 │
└───────────┴────────────┴──────────────┴────────────┴─────────────┴────────────┘

Analicemos los datos ahora que están en ClickHouse. Observa que la cantidad de datos aumenta con el tiempo a medida que se despliegan más sensores:

SELECT
    date,
    count()
FROM sensors
GROUP BY date
ORDER BY date ASC;

Podemos crear un gráfico en la SQL Console para visualizar los resultados:

Esta consulta cuenta el número de días demasiado calurosos y húmedos:

WITH
    toYYYYMMDD(timestamp) AS day
SELECT day, count() FROM sensors
WHERE temperature >= 40 AND temperature <= 50 AND humidity >= 90
GROUP BY day
ORDER BY day ASC;

A continuación se muestra una visualización del resultado:

Get started

Setup

Sample datasets

Migrate